More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3281 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  100 
 
 
278 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3393  fagellar hook-basal body protein  66.19 
 
 
276 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  38.13 
 
 
253 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  37.18 
 
 
248 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.49 
 
 
270 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4121  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.99 
 
 
251 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00427548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  36.65 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.33 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  34.12 
 
 
282 aa  156  3e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.51 
 
 
265 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  31.65 
 
 
282 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.51 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.27 
 
 
280 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  32.74 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  34.77 
 
 
249 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  32.62 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  34.41 
 
 
249 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 
265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  31.9 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  34.04 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  31.2 
 
 
246 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  30.21 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  27.72 
 
 
257 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  30.58 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  31.9 
 
 
244 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  31.79 
 
 
262 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1596  flagellar basal body rod protein FlgG  31.43 
 
 
257 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1559  flagellar basal body rod protein FlgG  31.43 
 
 
257 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1548  flagellar basal body rod protein FlgG  31.43 
 
 
257 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1719  flagellar basal body rod protein FlgG  31.43 
 
 
257 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.14 
 
 
263 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1792  flagellar basal body rod protein FlgG  30.71 
 
 
257 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  29.75 
 
 
246 aa  122  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  31.21 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.58 
 
 
242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.8 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1847  flagellar basal body rod protein FlgG  31.45 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0026  fagellar hook-basal body protein  31.27 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852017  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1738  flagellar basal body rod protein FlgG  31.45 
 
 
257 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3606  flagellar basal body rod protein FlgG  31.45 
 
 
257 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 
261 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  28.78 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  32.52 
 
 
262 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0334  flagellar basal body rod protein  33.45 
 
 
240 aa  119  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  33.57 
 
 
266 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  30 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  33.45 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.68 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.07 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  31.47 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.96 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  33.91 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1769  flagellar basal body rod protein FlgG  31.73 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1595  flagellar basal body rod protein FlgG  30 
 
 
257 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  31.91 
 
 
262 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.47 
 
 
260 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.47 
 
 
260 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  31.71 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  31.47 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1387  flagellar basal body rod protein FlgG  30.5 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.4 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  31.43 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.33 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  31.19 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  32.6 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  30.74 
 
 
253 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  32.23 
 
 
262 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  29.97 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  29.97 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  29.97 
 
 
263 aa  112  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1157  flagellar basal body rod protein  29.29 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  30.71 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  28.22 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  27.18 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  30.94 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.6 
 
 
261 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  31.62 
 
 
262 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  31.62 
 
 
262 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  32.26 
 
 
260 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.75 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  30.14 
 
 
262 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  29.76 
 
 
258 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.03 
 
 
265 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  31.62 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  27.18 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.01 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  32.01 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.39 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  31.56 
 
 
242 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  30.07 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.27 
 
 
266 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  27.18 
 
 
270 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.67 
 
 
261 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.74 
 
 
261 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.25 
 
 
261 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  34.62 
 
 
260 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  32.13 
 
 
261 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.64 
 
 
262 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>