More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1020 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  78.89 
 
 		 270 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  78.15 
 
 		 270 aa  441  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  77.78 
 
 		 270 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0522  flagellar basal-body rod protein  60.52 
 
 		 270 aa  340  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.133039  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2185  flagellar basal-body rod protein  55.22 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00385896  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0105  flagella basal body rod protein  56.62 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00280218  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  48.19 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  48.19 
 
 		 276 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.83 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.09 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  34.57 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.4 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  33.71 
 
 		 242 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  34.69 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.86 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  33.96 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.97 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  32.43 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  32.44 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  32.16 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  28.22 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  31.77 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3393  fagellar hook-basal body protein  28.82 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.04 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  30.34 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  29.82 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  29.59 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  29.86 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.43 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.43 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.44 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  28.57 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4121  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00427548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2702  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.48 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  30.55 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.52 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  29 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  29 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  28.15 
 
 		 245 aa  99  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  30.48 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.6 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.25 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  30.37 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.78 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  28.06 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  31.92 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  30.26 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.31 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  30.45 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  30.48 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.94 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  28.62 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  28.62 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.27 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  29.55 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.62 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0334  flagellar basal body rod protein  32.31 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.78 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.63 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.78 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  28.78 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0189  flagellar basal body rod protein FlgG  31.4 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  30.51 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.23 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  31.37 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  28.89 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0242  flagellar basal body rod protein FlgG  31 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  28.52 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.65 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.65 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.1 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.32 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  30.51 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.32 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.2 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.63 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  28.15 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  28.15 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  30.04 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  31.1 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.3 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.65 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  28.57 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  30.27 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  30 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  28.85 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  29.96 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  30.35 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.99 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  27.04 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  26.57 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  26.57 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  31.5 
 
 		 238 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>