More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2410 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  100 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.05 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  50.97 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  46.54 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.3 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  40.93 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.38 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  36.36 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  37.74 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  37.35 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  35.71 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  36.86 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  34.87 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.26 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  35.43 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  33.45 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  32.35 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.36 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  35.77 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.36 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  34.09 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  37.31 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.77 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  35.18 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  34.39 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2923  flagellar basal-body rod FlgG  35.94 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.25 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  34.13 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  35.34 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  35.2 
 
 		 248 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  36 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  38.84 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  33.83 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  34.15 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0522  flagellar basal-body rod protein  31.11 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.133039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  33.72 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2185  flagellar basal-body rod protein  33.33 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00385896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  35.95 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  36.47 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 239 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  35.98 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.61 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  31.65 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.18 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.6 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  36.15 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.47 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  32.56 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  35 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  33.98 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.13 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  35.34 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  30.4 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.96 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  37.07 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  33.07 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  33.46 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.54 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.15 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  35.94 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  33.87 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  33.46 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  32.68 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  35.55 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.19 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  35.55 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  33.85 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  35.55 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  35.55 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  35.55 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  31.98 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  35.55 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  35.55 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  35.11 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  32.95 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.12 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  34.9 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0105  flagella basal body rod protein  33.33 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00280218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  32.55 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.61 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  30.15 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.52 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  34.66 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.14 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  32.17 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.1 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  34.24 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.58 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  31.54 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  36.64 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>