More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1104 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  100 
 
 
276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0105  flagella basal body rod protein  49.28 
 
 
273 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00280218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  49.64 
 
 
270 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2185  flagellar basal-body rod protein  47.18 
 
 
269 aa  263  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00385896  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0522  flagellar basal-body rod protein  49.28 
 
 
270 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.133039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  49.28 
 
 
270 aa  258  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  48.19 
 
 
269 aa  258  1e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  49.28 
 
 
270 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  44.36 
 
 
267 aa  246  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  37.45 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.41 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.17 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.13 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  35.52 
 
 
248 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.5 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  32.06 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.17 
 
 
258 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  32.7 
 
 
263 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  32.7 
 
 
263 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  32.7 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  31.93 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.88 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  35.87 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.03 
 
 
261 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  32.38 
 
 
282 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.03 
 
 
261 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  32.06 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  31.75 
 
 
244 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  31.64 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  30.65 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  30.92 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.6 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.6 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  36.23 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  31.3 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  33.08 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  30.92 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  31.68 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  31.3 
 
 
262 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.91 
 
 
261 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.37 
 
 
260 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  31.3 
 
 
262 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.37 
 
 
260 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  30.53 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.97 
 
 
255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  33.21 
 
 
255 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.35 
 
 
260 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.35 
 
 
260 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  30 
 
 
261 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  30.91 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  32.36 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.3 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  32.84 
 
 
262 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.65 
 
 
262 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  28.79 
 
 
260 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 
262 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  33.59 
 
 
255 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.86 
 
 
262 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  29.93 
 
 
245 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.62 
 
 
261 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  31.64 
 
 
242 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.12 
 
 
261 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.08 
 
 
260 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.23 
 
 
266 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.88 
 
 
261 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  30.53 
 
 
262 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  31.13 
 
 
260 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  31.13 
 
 
260 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.55 
 
 
237 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.2 
 
 
263 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.52 
 
 
260 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  29.39 
 
 
261 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.77 
 
 
261 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  29.39 
 
 
261 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  32.41 
 
 
262 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  30.62 
 
 
264 aa  102  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  30.34 
 
 
262 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  29.39 
 
 
262 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.09 
 
 
267 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  29.96 
 
 
262 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.77 
 
 
260 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  31.78 
 
 
262 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.38 
 
 
262 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.96 
 
 
262 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  33.84 
 
 
266 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  31.78 
 
 
262 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  29.62 
 
 
238 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  29.96 
 
 
260 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 
262 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.96 
 
 
264 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>