More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2387 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.7 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  36.96 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  36.7 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  37.69 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  36.5 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.66 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  33.98 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.83 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  35.8 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.18 
 
 		 280 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.83 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.8 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  32.32 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  33.92 
 
 		 282 aa  141  9e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  33.8 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  32.62 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3393  fagellar hook-basal body protein  33.57 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  35.57 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  32.44 
 
 		 233 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  34.48 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  34.07 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  34.1 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  34.1 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  32.08 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.03 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  33.7 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  33.7 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  33.7 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  33.7 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  33.7 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  33.7 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  33.7 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  34.1 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  33.72 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  34.1 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  33.72 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  34.1 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.95 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.01 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  32.95 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  32.95 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4121  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.02 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00427548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  30.89 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  32.57 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.44 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.65 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.65 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  33.21 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  30.3 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.7 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.68 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  30.38 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  32.82 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  30.62 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.97 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.95 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  32.32 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  32.95 
 
 		 261 aa  118  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  30.74 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.86 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.95 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  31.3 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  30.74 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  33.21 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  31.27 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  31.02 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  30.65 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  32.53 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  32.46 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  32.53 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  30.95 
 
 		 238 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1157  flagellar basal body rod protein  31.27 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.8 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.8 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.97 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  29.39 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.12 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  30.92 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.89 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  32.46 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  30.83 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  32.31 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  31.8 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  30.92 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  30.53 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  30.57 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  31.54 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  31.54 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  30.53 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  29.21 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.76 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  31.18 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  30.86 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>