More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2232 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  36.9 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  38.94 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  35.37 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.35 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  39.83 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  36.43 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  38.26 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  39.83 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.41 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.11 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  39.22 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  36.4 
 
 		 253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.2 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  33.76 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  36.44 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  36.44 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  33.91 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  34.98 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  36.75 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  37.13 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.98 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  34.73 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  32.65 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  35.42 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  35.42 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  34.31 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  34.31 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  34.31 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  34.31 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  30.62 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  34.31 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  30.43 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  33.87 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  29.96 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.05 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  34.03 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  34.03 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  34.03 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  33.91 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  34.7 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  38.6 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  36.67 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.49 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  31.56 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  33.19 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.21 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  34.71 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  33.19 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  33.05 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.05 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  34.25 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  31.78 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  32.08 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  32.95 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  32.22 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  34.51 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.73 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  31.2 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.94 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.25 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  32.81 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.04 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  33.9 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.5 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  33.92 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.53 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.08 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  30.2 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  30.2 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  34.85 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.19 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  31.82 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  30.65 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  32.78 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.93 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  33.63 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  34.3 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.92 
 
 		 263 aa  101  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  32.57 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  36.28 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  30.38 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  32.07 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.32 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  30.52 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  34.44 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.32 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>