More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4713 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 248 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  85.89 
 
 		 248 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  69.8 
 
 		 246 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  68.98 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  68.98 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  68.16 
 
 		 246 aa  341  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  49 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  49.21 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  48.62 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  48.22 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  48.61 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  48.81 
 
 		 254 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  48.02 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  46.09 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  45.5 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  44.63 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  45.81 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  40.87 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  40.43 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  38.58 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  39.83 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.78 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  34.69 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.2 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  36.63 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  35.1 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  34.69 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  32.93 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  33.86 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  37.95 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.63 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  35.25 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.42 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  35.63 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  36.96 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  32.52 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  32.52 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  37.05 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  32.04 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.24 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  35.2 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  34.01 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  37.79 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  32.79 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  32.79 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  35.04 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  35.04 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  33.2 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  38.29 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.63 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  31.71 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.63 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  34.47 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  33.21 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.42 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  37.1 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.68 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.47 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.34 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.6 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.34 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  31.84 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  34.48 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  34.05 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  31.95 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  33.19 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  35.27 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  29.04 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  34.05 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  29.84 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  34.05 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  36.02 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  35 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  34.05 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  34.05 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  35.53 
 
 		 253 aa  108  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  34.05 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  38.1 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  35.34 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.51 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  34.05 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  34.52 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  34.47 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  33.72 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.57 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  34.2 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  31 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.94 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  34.91 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.69 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>