More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4194 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 
240 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  55.04 
 
 
238 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  57.38 
 
 
239 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  57.38 
 
 
239 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  54.43 
 
 
239 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  56.09 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  55.84 
 
 
238 aa  249  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  41.99 
 
 
245 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  35.44 
 
 
245 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  34.75 
 
 
239 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 
244 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  33.75 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  34.3 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  34.3 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  33.05 
 
 
240 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  32.79 
 
 
243 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  32.8 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  32.8 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  31.66 
 
 
269 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  33.05 
 
 
241 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  36.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  30.58 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  32.19 
 
 
247 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  37.05 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.15 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.19 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.76 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.58 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.05 
 
 
265 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  30.04 
 
 
243 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 
262 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  31.71 
 
 
246 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.62 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  31.87 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 
262 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  34.3 
 
 
253 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  33.87 
 
 
262 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.76 
 
 
246 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  33.87 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
262 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.52 
 
 
261 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  36.29 
 
 
249 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.56 
 
 
259 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  31.93 
 
 
245 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  37.65 
 
 
260 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
262 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
262 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  32.94 
 
 
262 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  33.76 
 
 
246 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  32.66 
 
 
262 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  30.24 
 
 
248 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  30.5 
 
 
258 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  28.81 
 
 
242 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  33.2 
 
 
261 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  32.68 
 
 
260 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  34.01 
 
 
262 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  35 
 
 
262 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  32.22 
 
 
262 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  32.22 
 
 
262 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  32.22 
 
 
262 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  32.4 
 
 
246 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  34.89 
 
 
266 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  32.22 
 
 
262 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  32.22 
 
 
262 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  31.93 
 
 
255 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  32.22 
 
 
262 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  32.22 
 
 
262 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  28.69 
 
 
242 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  28.69 
 
 
242 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  32.16 
 
 
262 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 
262 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  33.33 
 
 
262 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  32.16 
 
 
262 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  30.27 
 
 
262 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  30.27 
 
 
262 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.62 
 
 
259 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  30.8 
 
 
244 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  32.59 
 
 
262 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  30.16 
 
 
253 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  33.85 
 
 
262 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  30.16 
 
 
257 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  32.26 
 
 
262 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.37 
 
 
267 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  31.71 
 
 
246 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  31.3 
 
 
246 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  30.33 
 
 
249 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  30.3 
 
 
262 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  34.16 
 
 
253 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.86 
 
 
260 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 
253 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.95 
 
 
262 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 
253 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  28.63 
 
 
242 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 
253 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 
253 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 
253 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 
253 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 
253 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  29.3 
 
 
264 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>