More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1087 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  49.58 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  48.96 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  49.38 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  48.95 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  48.12 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  48.95 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  48.95 
 
 		 242 aa  235  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  47.3 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  46.61 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  47.03 
 
 		 243 aa  224  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  47.03 
 
 		 243 aa  224  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  46.89 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  44.96 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  44.4 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  42.02 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  42.32 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  35.89 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  34.16 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  31.28 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  33.72 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  35.83 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  30.42 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  30.08 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  31.5 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.5 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  32.57 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  31.89 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  30.89 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  30.89 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  27.61 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  32.5 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.02 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  30.04 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  30.24 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  32.19 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  33.07 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  31.6 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  30.36 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  34 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  34 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  32.03 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  32.2 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  30.98 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  31.62 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  31.89 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.43 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.87 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  32.2 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  30.59 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  32.2 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  30.43 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  29.1 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.91 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.91 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  29.96 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  32.45 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  30.27 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  33.47 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  29.48 
 
 		 242 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  27.2 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  31.37 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  27.8 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  31.23 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  29.63 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  29.02 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.59 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  30.45 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  28.3 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  30.5 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  31.02 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.17 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  28.74 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.46 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  27.55 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  27.55 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  27.55 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  27.55 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  27.55 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  27.55 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.4 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.04 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  27.55 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  28.11 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.73 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.63 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  30.77 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  31.5 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  31.05 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  32.78 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>