More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0692 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  99.59 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  95.87 
 
 		 242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  64.05 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  55.1 
 
 		 246 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  51.46 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  48.54 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  48.95 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  45.38 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  45 
 
 		 243 aa  211  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  45 
 
 		 243 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  46.03 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  45.04 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  43.39 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  42.56 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  43.51 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  40 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  34.84 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  34.51 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  31.97 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  34.78 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  34.82 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  32.37 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  34.51 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  34.31 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  32.8 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  38.14 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  31.88 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  31.54 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  32.79 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  32.22 
 
 		 238 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  35.83 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.45 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  31.98 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  30.42 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  30.42 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  31.98 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.34 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  34.12 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  34.12 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  34.12 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  34.12 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  34.12 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  34.12 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  34.12 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  32 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  32.94 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  31.6 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  28.69 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  32.39 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.08 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.43 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  32.02 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  31.23 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  33.89 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.08 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  30.98 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  32.51 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  30.23 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  30.83 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  28.62 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  32.11 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  32.11 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  32.11 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  32.67 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  31.42 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  31.95 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  31.3 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  31.66 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.66 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.16 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  31.66 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  32.77 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  32.14 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  29.66 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  30.68 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  28.68 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  30.68 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  31.1 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0026  fagellar hook-basal body protein  32.38 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.9 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  31.27 
 
 		 260 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  31.27 
 
 		 260 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.15 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>