More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2810 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  64.29 
 
 
241 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  49.58 
 
 
243 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  51.05 
 
 
242 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  49.37 
 
 
242 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  48.54 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  48.54 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  51.03 
 
 
246 aa  241  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  46.64 
 
 
239 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  46.03 
 
 
243 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  45.19 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  45.19 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  44.03 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  44.03 
 
 
244 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  44.86 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  41.67 
 
 
241 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  41.32 
 
 
244 aa  188  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  33.75 
 
 
238 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  141  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  34.17 
 
 
238 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  33.47 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  33.05 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  31.84 
 
 
256 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  33.05 
 
 
239 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.83 
 
 
244 aa  131  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  33.05 
 
 
240 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  31.15 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  31.15 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  32.8 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  28.31 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  30.98 
 
 
253 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  31.87 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  33.33 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  31.47 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  31.76 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.15 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  34.14 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  29.34 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  29.15 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  32 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.33 
 
 
242 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  34.18 
 
 
254 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  30.89 
 
 
248 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.84 
 
 
244 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  30.9 
 
 
246 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  28.63 
 
 
237 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  31.47 
 
 
254 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  27.71 
 
 
248 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  32.51 
 
 
258 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  29.87 
 
 
246 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.46 
 
 
259 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  29.03 
 
 
248 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  29.61 
 
 
246 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  28.69 
 
 
245 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  29.18 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  30.59 
 
 
248 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.89 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  30.89 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  30.89 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.86 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  29.62 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  28.02 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  30.12 
 
 
262 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  30.12 
 
 
262 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  30.12 
 
 
262 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  29.07 
 
 
260 aa  95.1  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.46 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  28.46 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  28.46 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  29.23 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  28.96 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  29.34 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  29.34 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  29.34 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  29.34 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  30.04 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  27.95 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  29.34 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  29.34 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  29.34 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  28.96 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  30.12 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  27.59 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.73 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.73 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  29.96 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.06 
 
 
261 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.65 
 
 
262 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 
262 aa  92  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  27.34 
 
 
262 aa  91.7  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  27.27 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.23 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  29.72 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  28.96 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  29.23 
 
 
260 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  29.28 
 
 
261 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  31.09 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  30.12 
 
 
260 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  30.12 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>