More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6504 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  64.05 
 
 		 242 aa  327  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  64.05 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  64.05 
 
 		 242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  55.6 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  56.5 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  51.05 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  47.9 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  48.12 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  48.32 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  48.32 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  47.35 
 
 		 244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  45.19 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  46.86 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  45.08 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  44.26 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  41.15 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  36.51 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  34.84 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  34.84 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  36.4 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  34.66 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  34.38 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  33.05 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  33.72 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  32.8 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  37.15 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  30.35 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  33.07 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  32.88 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  32.68 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  32.5 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.55 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.41 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  36.11 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  29.79 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06158  flagellar basal body rod protein FlgF  33.91 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00145829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01008  flagellar basal body rod protein FlgF  33.91 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  29.67 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  33.6 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  30.21 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  29.79 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  32.9 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  32.41 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  32.16 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  31.08 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  30.53 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  32.81 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  28.63 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  32.65 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  34 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.53 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  32.02 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  30.77 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.74 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.57 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  32.41 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  32.41 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  32.41 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2601  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.19 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.276057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  29.51 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  30.86 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1352  flagellar basal body rod protein  32.57 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  30.65 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  31.54 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.77 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  31.87 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  31.87 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.17 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  32.14 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  29.03 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.92 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2505  flagellar basal body rod protein  32.74 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0291035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  31.08 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  31.47 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.16 
 
 		 263 aa  95.1  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  31.91 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  30.52 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  31.75 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  30.12 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  29.03 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  31.91 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>