More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3048 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  98.37 
 
 		 246 aa  487  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  93.5 
 
 		 246 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  76.42 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  68.16 
 
 		 248 aa  341  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  66.53 
 
 		 248 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  46.25 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  46.06 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  43.82 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  45.45 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  45.02 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  45.63 
 
 		 254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  43.32 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  41.7 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  43.78 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  38.17 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  40.61 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  40.17 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  36.91 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  36.33 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  35.06 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  35.92 
 
 		 239 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.41 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  35.1 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  32.22 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.15 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  34.94 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.24 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.98 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.66 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  32.51 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  30.98 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  34.68 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  32.58 
 
 		 258 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  34.09 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  34.43 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  36.44 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.38 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  33.6 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  33.6 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.92 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  35.27 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  33.82 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  30.15 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  35.27 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.42 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  36.4 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  32.53 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.44 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  34.73 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  33.07 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.83 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  32.55 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.12 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  34.12 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  31.5 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  32.17 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  33.97 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.37 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  34.12 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  32.28 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.81 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.81 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  34.88 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  33.07 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1683  flagellar basal body rod protein FlgG  31.5 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.082538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.25 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  30.77 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.8 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  32.62 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.1 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.7 
 
 		 262 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  35.02 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.25 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.25 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.68 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.68 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  34.6 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.85 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>