More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7254 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  54.47 
 
 		 244 aa  248  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  43.57 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  41.67 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  41.56 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  44.63 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  40.16 
 
 		 253 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  42.75 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  39.44 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  41.83 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  41.91 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  39 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  38.55 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  38.59 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  38.17 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  41.49 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  41.53 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  39.29 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  41.43 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  36.84 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.68 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  37.13 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  35.37 
 
 		 247 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  36.09 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  33.2 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  37.21 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  34.89 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  35.09 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  37.24 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.06 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  35.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  35.06 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  35.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  34.47 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  34.73 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  32.33 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  32.47 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  32.74 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  31.43 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.75 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.59 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  36.25 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.98 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  31.88 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  31.38 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  31.03 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  31.03 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  31.88 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  31.47 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  33.18 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  35.74 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.88 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.6 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.25 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.25 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  33.19 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  30.53 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  32.88 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  32.16 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  34.73 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  35.78 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.7 
 
 		 270 aa  111  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  32.6 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.44 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  32.02 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  32.93 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  35.78 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  32.14 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.98 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  32.19 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.83 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  34.3 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.05 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.29 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.29 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.64 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  32.02 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.82 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  34.76 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.22 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.51 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.19 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.87 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  34.35 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  32.72 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  35.06 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  35.06 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  35.06 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.08 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  33.6 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.54 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  34.48 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  31.78 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.92 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>