More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4107 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  100 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  64.08 
 
 
242 aa  322  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  60.82 
 
 
242 aa  299  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  63.67 
 
 
238 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  56.91 
 
 
245 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  62.04 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  52.33 
 
 
258 aa  261  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  39.92 
 
 
248 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  41.41 
 
 
251 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.93 
 
 
258 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  37.5 
 
 
269 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  40.62 
 
 
253 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  38.4 
 
 
245 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  36.17 
 
 
282 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  38.43 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  38.43 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  38.43 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  38.43 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  38.43 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  35.18 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  38.43 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  38.43 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.7 
 
 
265 aa  144  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.66 
 
 
263 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  39.43 
 
 
259 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  38.43 
 
 
262 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.66 
 
 
259 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  38.13 
 
 
262 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.84 
 
 
270 aa  142  7e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  40.15 
 
 
261 aa  141  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  36.96 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.65 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  38.67 
 
 
262 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  38.52 
 
 
262 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.4 
 
 
262 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  40.16 
 
 
243 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  38.67 
 
 
262 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.6 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  38.67 
 
 
262 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  38.67 
 
 
262 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  38.67 
 
 
262 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.66 
 
 
260 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  37.35 
 
 
262 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  37.35 
 
 
262 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  36.61 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  35.04 
 
 
255 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.74 
 
 
263 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.68 
 
 
246 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.86 
 
 
244 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.02 
 
 
260 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.02 
 
 
260 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  37.05 
 
 
241 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  37.25 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  36.78 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  34.36 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  36.78 
 
 
260 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  35.5 
 
 
257 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1157  flagellar basal body rod protein  35.46 
 
 
245 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  37.64 
 
 
260 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  35.04 
 
 
244 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.58 
 
 
265 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  33.21 
 
 
262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  37.92 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  35.44 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.19 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  36.54 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.45 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  36.02 
 
 
262 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  33.81 
 
 
282 aa  130  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  34.65 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.75 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.08 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  34.11 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  35.25 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.05 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  34.75 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  34.88 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  34.88 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.64 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.08 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.43 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  36.14 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.1 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  37.89 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  32.82 
 
 
262 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  37.31 
 
 
260 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  37.15 
 
 
261 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  37.31 
 
 
260 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  36.64 
 
 
262 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  36.92 
 
 
260 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  37.31 
 
 
260 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.64 
 
 
262 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  37.15 
 
 
261 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  37.31 
 
 
260 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  37.31 
 
 
260 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  32.81 
 
 
233 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  37.11 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.94 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  36.08 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.94 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>