More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2114 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  59.49 
 
 		 239 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  59.07 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  55.27 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  56.09 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  54.51 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  49.16 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  39.06 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  37.66 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  38.75 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  38.19 
 
 		 253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  37.76 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  36.67 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.6 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  35.56 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  36.91 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  34.69 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  40.53 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  34.17 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  36.6 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  36.48 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  34.65 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  35.04 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.44 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  38.04 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  32.77 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  37.95 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  31.93 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  31.93 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  34.47 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  32.5 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.94 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  31.95 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  31.87 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  34.02 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  34.02 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  37.96 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.55 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  37.19 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  33.2 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  32.83 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  32.83 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  31.34 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.08 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  32.5 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  32.92 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  31.09 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  31.84 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  32.08 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  32.08 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  31.25 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  32.45 
 
 		 262 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  33.06 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  30.83 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  29.66 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  32.79 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  30.89 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  35.89 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.71 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  35.15 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  31.51 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  32.02 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.41 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  32.59 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  32.74 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  29.01 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  31.66 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  34.41 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  33.89 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  29.92 
 
 		 262 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.73 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.12 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  34.01 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  34.41 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  32.43 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  32.29 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.52 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  32.91 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.48 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.21 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  33.98 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>