More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3786 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  87.35 
 
 		 253 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  78.66 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  65.49 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  67.72 
 
 		 254 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  61.18 
 
 		 255 aa  322  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  59.84 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  49 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  46.61 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  47.01 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  46.25 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  45.02 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  45.45 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  40.4 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  40.4 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  39.44 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  37.94 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  39.53 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  36.51 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  37.76 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  36.47 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  36.1 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  38.12 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  34.26 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  38.7 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  36.73 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  36.33 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  36.33 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  35.92 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  36.73 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  33.98 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  35.69 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  35.22 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  35.51 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  35.1 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  35.1 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  35.1 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  35.1 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  35.1 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  35.1 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  34.36 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  35.1 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.36 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.73 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.57 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  34.51 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  34.51 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  35.2 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  35.2 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  34.4 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  35.57 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  36.44 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  36.55 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  30.56 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  35.6 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.12 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.57 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  31.08 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  31.08 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  31.03 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.96 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  34.4 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.07 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  35.02 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.07 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  34.45 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.65 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  36.55 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  36.12 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  33.09 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  34.94 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  34.94 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  34.94 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  34.71 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.46 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  36.84 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  33.33 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.83 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.69 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.94 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.47 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  35.22 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  32.67 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.02 
 
 		 267 aa  121  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  34.16 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.68 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  37.34 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  35.68 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  35.68 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>