More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5509 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  67.84 
 
 		 255 aa  348  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  62.75 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  61.02 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  67.32 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  59.84 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  62.6 
 
 		 253 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  48.02 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  47.43 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  45.31 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  44.66 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  42.46 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  43.43 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  42.29 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  42.4 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  40.08 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  40.94 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  42.91 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  39.68 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  37.55 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  37.88 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.18 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  40.47 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  34.65 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  38.33 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.34 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  33.99 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  36.96 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.43 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  34.39 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.54 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.6 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  34.25 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  36.9 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  35.52 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  32.4 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  37 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  36.36 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  35.69 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  34.93 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  32.81 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  38.2 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  32.31 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  32.14 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  35.16 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  35.16 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.41 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.41 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  37.13 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.74 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  32.54 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  36.33 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  32.83 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  32.83 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.05 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  32.95 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  32.06 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.72 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.48 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  33.08 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.71 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  34.21 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  34.21 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  34.08 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.32 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.6 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  33.98 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  35.59 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  35.96 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.84 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.84 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.86 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  35.96 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  35.96 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  37.61 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  31.75 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  36.52 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  32.71 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  32.71 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  32.71 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.26 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.73 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  31.58 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.73 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  31.58 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>