More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0301 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  55.46 
 
 
241 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  49.38 
 
 
244 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  49.38 
 
 
244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  49.79 
 
 
244 aa  251  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  46.64 
 
 
240 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  46.81 
 
 
243 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  45.96 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  45.96 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  45.19 
 
 
241 aa  218  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  45.19 
 
 
242 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  46.03 
 
 
242 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  46.03 
 
 
242 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  45.19 
 
 
242 aa  207  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  42.02 
 
 
243 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  44.03 
 
 
246 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  42.56 
 
 
244 aa  184  9e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  36.59 
 
 
238 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  36.67 
 
 
238 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  34.75 
 
 
240 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  35.98 
 
 
239 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  37.61 
 
 
239 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  37.61 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  34.96 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  34.02 
 
 
245 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  36.64 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  37.45 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  31.15 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.66 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.09 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  32.41 
 
 
253 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  33.47 
 
 
244 aa  121  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  29.1 
 
 
269 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 
248 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  31.5 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  31.35 
 
 
258 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  32.52 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  32.69 
 
 
255 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.22 
 
 
259 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  31.85 
 
 
245 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 
246 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  30.27 
 
 
255 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  31.6 
 
 
248 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 
248 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.54 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  32.94 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  32.24 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  32.14 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.74 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.38 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  31.8 
 
 
253 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  31.85 
 
 
249 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  32.24 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  30.99 
 
 
238 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  29.69 
 
 
251 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  32.28 
 
 
249 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.71 
 
 
246 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.42 
 
 
246 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.42 
 
 
246 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.14 
 
 
244 aa  98.6  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  27.34 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.92 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  32.63 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  28.72 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  31.03 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  33.05 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  29.06 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  32.54 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  32.2 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  26.25 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.48 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  33.89 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  33.89 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  30.28 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  33.33 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  32.35 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  27.63 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  32.14 
 
 
252 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  33.88 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  33.05 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  32.1 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  32.22 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  33.47 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.08 
 
 
270 aa  89.4  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  32.64 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0105  flagella basal body rod protein  26.74 
 
 
273 aa  89  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00280218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  27.03 
 
 
250 aa  89  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  30.28 
 
 
252 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  31.75 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  31.75 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  31.75 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>