More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2517 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  72.09 
 
 		 260 aa  363  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  64.98 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  55.51 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.05 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  38.93 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  36.47 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  37.22 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.3 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.62 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  34.59 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.88 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  36.8 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.66 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  37.74 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  34.98 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  35.96 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  39.83 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  39.83 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  36.43 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.45 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  36.94 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  35.27 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  37.45 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  34.33 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  38.59 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  36.06 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  36.47 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2185  flagellar basal-body rod protein  34.44 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00385896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  35.09 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.19 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  33.71 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  35.97 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  37.2 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.64 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  33.84 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  37.04 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.38 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  37.04 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  35.34 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  34.41 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  35 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0522  flagellar basal-body rod protein  34.46 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.133039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  33.83 
 
 		 269 aa  129  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  36.57 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  35.09 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  36.57 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  34.09 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  34.09 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  36.19 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.56 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.32 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  36.19 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.56 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.06 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  34.41 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  33.82 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  34.33 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  32.96 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  34.29 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  35.74 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  35.07 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.45 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  34.63 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.07 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.09 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  34.98 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  38.08 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  38.08 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.21 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  35.88 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.21 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.46 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.09 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  38.08 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  34.98 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.96 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.12 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.12 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  35.27 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  36.78 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.47 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.08 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  33.33 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>