More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0522 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0522  flagellar basal-body rod protein  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.133039  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2185  flagellar basal-body rod protein  66.54 
 
 
269 aa  379  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00385896  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0105  flagella basal body rod protein  66.67 
 
 
273 aa  374  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00280218  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  60.52 
 
 
269 aa  340  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  60.52 
 
 
270 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  60.15 
 
 
270 aa  333  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  59.78 
 
 
270 aa  330  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  49.63 
 
 
267 aa  292  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  49.28 
 
 
276 aa  261  8.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  38.74 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  36.25 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.46 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.11 
 
 
258 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  32.6 
 
 
282 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.47 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  35.66 
 
 
260 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.45 
 
 
270 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  33.09 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  30.08 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  32.58 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.7 
 
 
266 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  32.58 
 
 
246 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  30.27 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  34.75 
 
 
260 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  32.27 
 
 
245 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.83 
 
 
242 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  30.71 
 
 
246 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  31.29 
 
 
269 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.71 
 
 
265 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  32.1 
 
 
253 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  32 
 
 
253 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  32.8 
 
 
255 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  30.63 
 
 
246 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  30.26 
 
 
246 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  30.48 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.59 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  29.14 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  30.11 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  32.47 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  29.52 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  30.57 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.98 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  29.56 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  29.27 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  31.54 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  28.24 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  31.01 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  32.71 
 
 
262 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.71 
 
 
262 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  31.01 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.84 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  27.97 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  31.87 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.84 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.16 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.16 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.07 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.4 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  30.04 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  30.23 
 
 
261 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.32 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.93 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.32 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  31.4 
 
 
262 aa  92  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  30 
 
 
248 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.4 
 
 
261 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  29.7 
 
 
260 aa  92  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.6 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.81 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  26.02 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.67 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  29.28 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  29.96 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  29.96 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  28.2 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  28.2 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  29.7 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  30.04 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  28.94 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  30.8 
 
 
260 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.91 
 
 
261 aa  89  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.97 
 
 
261 aa  89  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  28.96 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  28.91 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  29.28 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.08 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>