More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3159 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  100 
 
 
260 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  64.98 
 
 
259 aa  362  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  70.38 
 
 
260 aa  359  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  51.53 
 
 
265 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.97 
 
 
258 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  38.46 
 
 
248 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  38.02 
 
 
251 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.36 
 
 
255 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  37.64 
 
 
244 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  36.53 
 
 
270 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  36.67 
 
 
267 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  35.66 
 
 
269 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  37.23 
 
 
270 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  36.53 
 
 
270 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.35 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  35.38 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  37.64 
 
 
242 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.05 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.49 
 
 
270 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  36.6 
 
 
261 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  34.72 
 
 
255 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  34.47 
 
 
262 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.6 
 
 
260 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  35.66 
 
 
261 aa  141  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  35.79 
 
 
258 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  33.46 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2185  flagellar basal-body rod protein  35.21 
 
 
269 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00385896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  35.83 
 
 
243 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.88 
 
 
261 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.96 
 
 
263 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.88 
 
 
261 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0522  flagellar basal-body rod protein  35.66 
 
 
270 aa  138  7e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.133039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  38.28 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  34.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  36.15 
 
 
261 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  36.15 
 
 
261 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.5 
 
 
261 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.73 
 
 
259 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.69 
 
 
261 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  35.91 
 
 
245 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  35.87 
 
 
276 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 
256 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  34.96 
 
 
246 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.11 
 
 
266 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.11 
 
 
266 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.27 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.69 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.27 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.27 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.85 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  35.23 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.75 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.85 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.23 
 
 
260 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.23 
 
 
260 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.26 
 
 
267 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  34.72 
 
 
282 aa  132  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  33.61 
 
 
246 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 
261 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  34.34 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  34.34 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  34.34 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  34.34 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  34.34 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.08 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  34.34 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  34.34 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  34.5 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.33 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.88 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  33.85 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  32.82 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  31.47 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  35.36 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  34.11 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  33.85 
 
 
262 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 
262 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0105  flagella basal body rod protein  34.32 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00280218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  33.46 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 
262 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  34.35 
 
 
257 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 
262 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  32.95 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  34.23 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.96 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.56 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  35.56 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  33.96 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  34.52 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.93 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.69 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  33.21 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  33.21 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  34.88 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  31.78 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  35.58 
 
 
266 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>