More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1545 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  100 
 
 
267 aa  547  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2185  flagellar basal-body rod protein  53.01 
 
 
269 aa  297  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00385896  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0522  flagellar basal-body rod protein  49.63 
 
 
270 aa  292  4e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.133039  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0105  flagella basal body rod protein  51.48 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00280218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  48.15 
 
 
270 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  47.78 
 
 
270 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  47.78 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  48.19 
 
 
269 aa  273  3e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  44.36 
 
 
276 aa  246  4e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.59 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.71 
 
 
259 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  33.6 
 
 
248 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.83 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  36.67 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  34.17 
 
 
282 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.98 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.55 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.95 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  32.94 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  32.34 
 
 
246 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.74 
 
 
260 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.74 
 
 
260 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  31.44 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  32.3 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  32.32 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  34.36 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  31.23 
 
 
246 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  31.23 
 
 
246 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.06 
 
 
262 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  30.86 
 
 
253 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  32.1 
 
 
244 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  28.67 
 
 
258 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  31.38 
 
 
260 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  32.24 
 
 
261 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  30.92 
 
 
245 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  32.24 
 
 
261 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  32.34 
 
 
248 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  30.31 
 
 
253 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  30.5 
 
 
282 aa  102  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  31.85 
 
 
248 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.74 
 
 
260 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.74 
 
 
260 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  33.06 
 
 
261 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  33.08 
 
 
262 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.08 
 
 
262 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  30.48 
 
 
269 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  33.2 
 
 
246 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.47 
 
 
262 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  31 
 
 
244 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.71 
 
 
261 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  31.13 
 
 
262 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  33.09 
 
 
246 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  30.5 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  32.02 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  32.02 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  31.23 
 
 
262 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  31.23 
 
 
262 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  31.4 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  30.12 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.58 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.72 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  33.21 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  30.26 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  30.43 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  33.72 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  32.82 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  32.82 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  29.04 
 
 
245 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  29.92 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  34.58 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  31.43 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2264  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.06 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  30.04 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  26.49 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  29.06 
 
 
239 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  27.61 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.92 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  29.67 
 
 
241 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2703  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.98 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  30 
 
 
262 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  29.57 
 
 
239 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.26 
 
 
255 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  30.86 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  29.8 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.96 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  30.83 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  30.83 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  32.05 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.99 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  32.38 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>