More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1327 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  98.74 
 
 		 239 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  84.52 
 
 		 239 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  60.76 
 
 		 238 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  59.07 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  57.14 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  54.43 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  39.15 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  38.43 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  36.25 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  38.03 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  37.55 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  36.33 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  36.33 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  36.33 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  34.68 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  35.51 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  34.43 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.5 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  31.15 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  31.56 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  33.91 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  37.5 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 253 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  31.3 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  35.06 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  31.69 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  35.06 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.17 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  34.66 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  34.66 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  31.2 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  31.2 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  33.88 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  35.54 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.34 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  30.42 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  31.35 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  30.42 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  34.02 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  36.44 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.87 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.35 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  32.54 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  31.7 
 
 		 261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  29.17 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  32.63 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  32.31 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  35.71 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  30.21 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  32.95 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  32.17 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  30.8 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.89 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  31.58 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  31.52 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  31.88 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  32.24 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  31.78 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  32.39 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  33.2 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  34.51 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  28.69 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  30.08 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  33.06 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1121  flagellar basal body rod protein FlgG  31.52 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  30.83 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.63 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  33.73 
 
 		 262 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  29.6 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.8 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.12 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2923  flagellar basal-body rod FlgG  32.55 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.89 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  30.57 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  32.61 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  30.57 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  31.62 
 
 		 280 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  31.2 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  31.27 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  32.21 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.89 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  31.95 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  32.21 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.15 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  31.95 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  31.32 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  30.38 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.6 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  31.44 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  32.53 
 
 		 262 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>