More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1507 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  78.04 
 
 		 255 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  72.94 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  68.11 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  68.36 
 
 		 253 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  68.11 
 
 		 253 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  67.32 
 
 		 254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  48.81 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  50.59 
 
 		 248 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  49.01 
 
 		 246 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  48.22 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  47.1 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  45.95 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  42.8 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  40.64 
 
 		 245 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  39.92 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  42.69 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  42.97 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  38.33 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  37.92 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  38.43 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  36.65 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  36.08 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  40.81 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  37.2 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.26 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  37.93 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  40 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.69 
 
 		 260 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  34.52 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.06 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  37.4 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  38.52 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  38.52 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  34.23 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  38.52 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  38.52 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  38.52 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.78 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  38.52 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.37 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.37 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  33.98 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  37.13 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  38.11 
 
 		 262 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.58 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.14 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  36.19 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  37.65 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  33.98 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  35.69 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  32.95 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.1 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  40.34 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  35.25 
 
 		 269 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  33.07 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  38.98 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  33.46 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.11 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.87 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  37.5 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.36 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.5 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  39.66 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.25 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.71 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  32.68 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.71 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.99 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  37.94 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  37.94 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.83 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  37.17 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  39.24 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.24 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  39.24 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  39.24 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  39.24 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  39.24 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  39.24 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  39.24 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  39.24 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  39.24 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  35.37 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  31.97 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  34.18 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.18 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>