More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3477 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  44.77 
 
 
245 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  36.96 
 
 
253 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  39.76 
 
 
253 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  36.4 
 
 
255 aa  148  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  36.47 
 
 
253 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  36.14 
 
 
238 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  38.04 
 
 
254 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  36.21 
 
 
256 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  34.69 
 
 
238 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  35.29 
 
 
255 aa  135  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  36.33 
 
 
248 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.37 
 
 
246 aa  134  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  34.84 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  34.43 
 
 
246 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  32.11 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  34.69 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  37.07 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  33.91 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  31.69 
 
 
238 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  35.25 
 
 
248 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  36.22 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  33.48 
 
 
239 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  36.32 
 
 
244 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  32.92 
 
 
246 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  32.51 
 
 
246 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  35.87 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  32.19 
 
 
240 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.54 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  34.05 
 
 
245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  34.25 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  34.25 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  34.25 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  34.25 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  34.25 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  34.25 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  34.25 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  32.52 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.13 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.99 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.99 
 
 
260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.6 
 
 
265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  33.86 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.6 
 
 
260 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  34.9 
 
 
261 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.6 
 
 
260 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  32.13 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  32.83 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  32.83 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  33.47 
 
 
262 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  33.07 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  33.07 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  33.07 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.26 
 
 
247 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  32.68 
 
 
262 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  30.74 
 
 
244 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  32.68 
 
 
262 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  33.07 
 
 
262 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.56 
 
 
244 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.57 
 
 
255 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  33.46 
 
 
260 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  31.98 
 
 
262 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.07 
 
 
259 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  31.98 
 
 
262 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.73 
 
 
260 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  29.87 
 
 
244 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  32.41 
 
 
260 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  29.92 
 
 
260 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 
262 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  32.81 
 
 
261 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  33.59 
 
 
260 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  32.81 
 
 
261 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  32.81 
 
 
261 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  32.81 
 
 
261 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.83 
 
 
266 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  30.77 
 
 
262 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  29.1 
 
 
241 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.83 
 
 
260 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2747  fagellar hook-basal body protein  31.73 
 
 
262 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000847509  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  28.69 
 
 
261 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  34.86 
 
 
260 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  34.13 
 
 
280 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  28.69 
 
 
261 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  32.14 
 
 
262 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  34 
 
 
247 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  30.45 
 
 
238 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  31.15 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.28 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  30.19 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.37 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  30.8 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  28.51 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  30.28 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  31.87 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  31.89 
 
 
261 aa  99  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  31.25 
 
 
261 aa  99  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>