More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2961 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  57.14 
 
 		 239 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  56.72 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  55.93 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  55.17 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  54.51 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  55.84 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  38.02 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  37.87 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  36.64 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  36.44 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  33.05 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  33.19 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  34.44 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  38.52 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  31.69 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  33.19 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.68 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  32.77 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  35.48 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  33.76 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.74 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  31.93 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  32.22 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  30.29 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  32.92 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  30.29 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  32.24 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  31.8 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.93 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  31.73 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  32.5 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.91 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  33.18 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  32.68 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  32.72 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.32 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  33.6 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  31.28 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  32.51 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.22 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  33.19 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  31.69 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.14 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  32.07 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  35.02 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  34.87 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  34.55 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  30.35 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  32.37 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  32.38 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  31.95 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  32.38 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.43 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.66 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  32.94 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  32.1 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  33.07 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  32.1 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  32.94 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  33.61 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  31.95 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  33.61 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  32.14 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  32.14 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.33 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.56 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  32.64 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.64 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.94 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  29.1 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.74 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  33.47 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  33.47 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  33.47 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  33.2 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  33.47 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  33.2 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  29.49 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.5 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  33.74 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  29.62 
 
 		 276 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  31.56 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  34.3 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  31.56 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  31.56 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  34.3 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  31.56 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  31.56 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  31.89 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>