More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0729 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  67.62 
 
 		 244 aa  348  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  67.21 
 
 		 244 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  56.97 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  49.79 
 
 		 239 aa  251  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  48.52 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  49.37 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  49.37 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  47.35 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  44.86 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  45.68 
 
 		 241 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  44.4 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  47.33 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  45.45 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  45.04 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  44.63 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  37.25 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  35.68 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  35.16 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  36.44 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  31.42 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.55 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  34.48 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  31.03 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  29.84 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  34.66 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  31.95 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  31.56 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  31.56 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  30.87 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.31 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  33.2 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  31.71 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  30.77 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  32.68 
 
 		 253 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  28.57 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  30.2 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  33.07 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  29.72 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  34.48 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.74 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  31.56 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  31.15 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  28.78 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  29.61 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  28.05 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  32.33 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  27.24 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  27.64 
 
 		 246 aa  101  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.96 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  28.05 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.2 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  28.02 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  28.03 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  31.08 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  27.12 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  28.4 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  28.97 
 
 		 249 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  31.37 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  31.84 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  32.33 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  30.42 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.18 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  33.33 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.88 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  28.99 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.48 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  32.77 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.94 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.88 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.92 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.92 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  29.37 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  29.37 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.11 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  30 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  30 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.49 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.37 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.93 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  29 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  29 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  29 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  29 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  31.72 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  29 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  29 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  29.67 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  29 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.55 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  29.55 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.63 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  29.74 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.63 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  28.95 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.17 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>