More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1709 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  100 
 
 		 246 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  56.5 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  55.1 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  55.1 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  55.1 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  52.03 
 
 		 241 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  51.03 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  49.38 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  42.98 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  42.56 
 
 		 243 aa  207  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  42.56 
 
 		 243 aa  207  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  44.03 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  40.73 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  43.21 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  40.32 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  37.25 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  37.2 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  35.51 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  35.86 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  31.37 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  35.04 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  30.61 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  34 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  31.64 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  31.05 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  30.8 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  30.71 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  34.88 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.85 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  36.75 
 
 		 254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  33.73 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  28.52 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  31.62 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  31.69 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  29.92 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  31.73 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  30.71 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  30.74 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  28.69 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.34 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  28.69 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.04 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  27.64 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  27.87 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  28.78 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  28.98 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.11 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  32.07 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  31.94 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  34.2 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  27.87 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  31.65 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.51 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  29.84 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  28.57 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  26.75 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  28.35 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.54 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.54 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  33.6 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  26.72 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.39 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  34.75 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  28.29 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.44 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01008  flagellar basal body rod protein FlgF  30.97 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  26.36 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06158  flagellar basal body rod protein FlgF  30.97 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00145829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.69 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4675  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.62 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.13 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.06 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  26.48 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.86 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1157  flagellar basal body rod protein  27.73 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1557  flagellar basal body rod protein  31.09 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.14 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  30.47 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2703  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.35 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.12 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.05 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.12 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  25 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  30.89 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  32.05 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.4 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  28.14 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1591  flagellar basal body rod protein FlgF  30.77 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  28.62 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>