More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1157 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1157  flagellar basal body rod protein  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  33.74 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  35.86 
 
 		 245 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.46 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  33.86 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  33.46 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.05 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.14 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  33.46 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  31.27 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  33.05 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  33.2 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  29.29 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  29.69 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.59 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  30.89 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.15 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.52 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  31.2 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.08 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.65 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  30.04 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  31.84 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  30.43 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0334  flagellar basal body rod protein  31.05 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  30.5 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  31.01 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.41 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  29.87 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  30.29 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3393  fagellar hook-basal body protein  27.6 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.33 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  32.28 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.48 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  28.57 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  30.74 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  29.96 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  29.87 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  31.64 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.32 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.04 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  28.52 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  27.54 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.89 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  29.25 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  30.2 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.43 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  28.09 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  29.89 
 
 		 264 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  28.09 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  29.44 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.06 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  27.88 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  28.35 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  29.13 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  28.35 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  27.23 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  30.27 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  29.32 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.8 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.8 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  28.89 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  30.31 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  31.84 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.37 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  28.69 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  29.02 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  26.4 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  29.13 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.71 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  29.66 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  28.25 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  29.11 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  28.74 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  26.52 
 
 		 269 aa  90.9  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  29.04 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  27.94 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  30.04 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  28.35 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  28.99 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  27.72 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  29.01 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  28.09 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.41 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  29.61 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  30.21 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.4 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  27.76 
 
 		 259 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  28.31 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  27.82 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  27.34 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  28.98 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  31.02 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  29.89 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  28.78 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  26.52 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  28.29 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  28.29 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  29.75 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>