More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4121 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4121  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00427548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  43.75 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  41.11 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  38.65 
 
 
282 aa  171  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.58 
 
 
270 aa  169  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  38.89 
 
 
248 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  38.99 
 
 
278 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  41.09 
 
 
255 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.82 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  35.56 
 
 
282 aa  162  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  38.67 
 
 
259 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3393  fagellar hook-basal body protein  37.68 
 
 
276 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.06 
 
 
255 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  36.55 
 
 
246 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.86 
 
 
280 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  35.91 
 
 
257 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.41 
 
 
267 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  35.34 
 
 
246 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  34.22 
 
 
260 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  36.02 
 
 
257 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0026  fagellar hook-basal body protein  36.11 
 
 
232 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852017  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.55 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  36.7 
 
 
266 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.56 
 
 
244 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.58 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  33.96 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  30.23 
 
 
233 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  31.76 
 
 
245 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  29.57 
 
 
249 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  30.04 
 
 
249 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  33.21 
 
 
255 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.05 
 
 
242 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  34.73 
 
 
261 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  35.21 
 
 
260 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.25 
 
 
260 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  34.87 
 
 
261 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  32.55 
 
 
253 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.08 
 
 
260 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.08 
 
 
266 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.3 
 
 
265 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  31.91 
 
 
269 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.81 
 
 
266 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  29.41 
 
 
270 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  30.55 
 
 
270 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.09 
 
 
270 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.58 
 
 
260 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.58 
 
 
260 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2264  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.18 
 
 
262 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  32.39 
 
 
248 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  34.72 
 
 
260 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  31.64 
 
 
246 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  32.71 
 
 
258 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  40.68 
 
 
260 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.85 
 
 
258 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.1 
 
 
260 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.14 
 
 
261 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  32.82 
 
 
242 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  29 
 
 
269 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  32.7 
 
 
260 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.96 
 
 
261 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  34.46 
 
 
260 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.58 
 
 
260 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  32.3 
 
 
242 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  32.11 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.6 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  30.18 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  32.95 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.73 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.22 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  32.58 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.02 
 
 
261 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  32.16 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  30.31 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  33.46 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  35 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  35.11 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  35.11 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  31.94 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.5 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.69 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  33.98 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.69 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.08 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.58 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  32.82 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.82 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  33.46 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  32.82 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  32.82 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  32.82 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  32.82 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.05 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  32.83 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  33.85 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  33.85 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  32.83 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>