153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0332 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  100 
 
 		 313 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  87.5 
 
 		 312 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  85.44 
 
 		 314 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  85.62 
 
 		 304 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  85.95 
 
 		 304 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  87.25 
 
 		 304 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  85.28 
 
 		 305 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  84.39 
 
 		 327 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  82.94 
 
 		 302 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  78.67 
 
 		 305 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  77.26 
 
 		 302 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  74.03 
 
 		 312 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  71.24 
 
 		 302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  69 
 
 		 307 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  71.33 
 
 		 295 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  62.33 
 
 		 290 aa  381  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  55.48 
 
 		 296 aa  339  4e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  47.54 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  47.04 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  46.32 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  43.06 
 
 		 323 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  43.24 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.58 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  37.15 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  37.15 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  37.15 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  36.81 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  37.93 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  37.24 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  37.59 
 
 		 286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  37.06 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  36.43 
 
 		 275 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  36.43 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  36.36 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.81 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  34.88 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 289 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  35.86 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.92 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  33.1 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  33.9 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  36.59 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  33.92 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  36.88 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  33.33 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  33.58 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  33.21 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  35.34 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  32.78 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.31 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  31.38 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  32.62 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  33.67 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  34.42 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  34.42 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  34.42 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  34.6 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  32.87 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  34.92 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.66 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  32.29 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  42.33 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  42.33 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.96 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  33.92 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  34.25 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  31.39 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  35.09 
 
 		 281 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  36.73 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  33.1 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  31.12 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  33.47 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  30.96 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  31.9 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  34.15 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  30.95 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  30.95 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  30.95 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  30.95 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  30.95 
 
 		 368 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  30.95 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>