More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0283 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.09 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  28.68 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.21 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.81 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  33.63 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  36.23 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35.63 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  26.45 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  30.68 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  25.19 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31.71 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  30.97 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  29.31 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.55 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>