145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3682 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  100 
 
 
637 aa  1301    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  61.78 
 
 
633 aa  761    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  54.37 
 
 
610 aa  625  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  33.54 
 
 
655 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  33.6 
 
 
655 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  26.98 
 
 
588 aa  212  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  26.05 
 
 
580 aa  164  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25.72 
 
 
580 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  25.26 
 
 
575 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  25 
 
 
575 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  27.69 
 
 
720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.88 
 
 
653 aa  127  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.56 
 
 
656 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.56 
 
 
656 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  28.18 
 
 
563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  28.16 
 
 
589 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  25.3 
 
 
618 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.99 
 
 
615 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.36 
 
 
592 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.36 
 
 
592 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  28.22 
 
 
1153 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.55 
 
 
619 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  23.89 
 
 
610 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  25.93 
 
 
585 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  25.93 
 
 
585 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.6 
 
 
612 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  24.15 
 
 
610 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  24.15 
 
 
610 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  24.15 
 
 
612 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.15 
 
 
610 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  26.1 
 
 
585 aa  95.1  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  25.69 
 
 
627 aa  94  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  21.54 
 
 
615 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.22 
 
 
612 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  25.51 
 
 
601 aa  90.1  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.99 
 
 
578 aa  89  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  24.94 
 
 
577 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  22.77 
 
 
613 aa  88.6  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  21.64 
 
 
584 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  21.64 
 
 
584 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.63 
 
 
577 aa  84.3  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  24.81 
 
 
621 aa  82.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  29.54 
 
 
640 aa  82  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  23.01 
 
 
601 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  26.77 
 
 
617 aa  80.9  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.05 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.55 
 
 
991 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  22.09 
 
 
631 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.93 
 
 
577 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  24.21 
 
 
637 aa  77.4  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.83 
 
 
580 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  21.43 
 
 
604 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  22.87 
 
 
631 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  23.39 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  32.08 
 
 
557 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  21.78 
 
 
629 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  27.61 
 
 
580 aa  75.1  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.22 
 
 
582 aa  74.3  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  25.14 
 
 
602 aa  73.9  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.39 
 
 
582 aa  73.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.39 
 
 
582 aa  73.9  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  29.39 
 
 
582 aa  73.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  24.26 
 
 
813 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.12 
 
 
592 aa  73.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  21.19 
 
 
604 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  24.85 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  23.75 
 
 
998 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  26.96 
 
 
600 aa  70.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  24.22 
 
 
810 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  26.77 
 
 
615 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  27.51 
 
 
546 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  23.55 
 
 
998 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  25.19 
 
 
799 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  23.82 
 
 
842 aa  68.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  25.31 
 
 
599 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  27.36 
 
 
610 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  29.31 
 
 
570 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  22.42 
 
 
642 aa  67  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.56 
 
 
586 aa  67  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.38 
 
 
613 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  22.42 
 
 
642 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  21.62 
 
 
819 aa  66.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  22.42 
 
 
642 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  22.98 
 
 
594 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  22.42 
 
 
642 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  22.42 
 
 
642 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  23.19 
 
 
635 aa  63.9  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  24 
 
 
625 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  27.1 
 
 
578 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  24.7 
 
 
621 aa  63.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  23.47 
 
 
611 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  24.62 
 
 
584 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  22.01 
 
 
639 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  26.33 
 
 
601 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  23.17 
 
 
1148 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  24.78 
 
 
606 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  21.47 
 
 
599 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  22.49 
 
 
607 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  28.22 
 
 
574 aa  60.8  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  28.05 
 
 
545 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>