158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0181 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 655 aa  1307    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  96.03 
 
 		 655 aa  1231    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  36.26 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  33.54 
 
 		 637 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  30.63 
 
 		 633 aa  256  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  30.1 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  30.65 
 
 		 580 aa  198  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  30.43 
 
 		 580 aa  196  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  28.34 
 
 		 585 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  28.34 
 
 		 585 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  29.05 
 
 		 720 aa  158  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  24.49 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  26.36 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  24.61 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  23.87 
 
 		 653 aa  125  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  24 
 
 		 656 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  24 
 
 		 656 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  29.08 
 
 		 617 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.56 
 
 		 612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.05 
 
 		 612 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  32.94 
 
 		 1153 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  27.23 
 
 		 635 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.28 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  24.02 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  24.02 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  24.02 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.02 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  29.15 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  31.1 
 
 		 640 aa  106  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.25 
 
 		 563 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  28.33 
 
 		 627 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  26.57 
 
 		 614 aa  99.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  24.73 
 
 		 625 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  30.49 
 
 		 600 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  30.79 
 
 		 615 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  29.48 
 
 		 637 aa  98.6  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.21 
 
 		 615 aa  97.4  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.36 
 
 		 592 aa  96.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.36 
 
 		 592 aa  96.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  27.36 
 
 		 601 aa  96.3  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  25 
 
 		 580 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  24.16 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  21.42 
 
 		 613 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.06 
 
 		 580 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  24.16 
 
 		 631 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 631 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  22.94 
 
 		 601 aa  90.9  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  25.38 
 
 		 621 aa  90.9  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  29.58 
 
 		 589 aa  90.9  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.36 
 
 		 577 aa  90.9  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.02 
 
 		 813 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.38 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  30.93 
 
 		 616 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  29.69 
 
 		 991 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.41 
 
 		 580 aa  88.6  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  28.89 
 
 		 599 aa  88.2  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.85 
 
 		 618 aa  87.4  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.87 
 
 		 578 aa  87  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  21.47 
 
 		 615 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  23.94 
 
 		 639 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.65 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  22.16 
 
 		 604 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  26.04 
 
 		 599 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  27.87 
 
 		 645 aa  84.7  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  27.41 
 
 		 621 aa  84.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.38 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.9 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.9 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  26.9 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.25 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 607 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  28.61 
 
 		 592 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  30.42 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  25.53 
 
 		 610 aa  82  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  23.96 
 
 		 810 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  31.15 
 
 		 570 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.44 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  25.94 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  21.86 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  25.91 
 
 		 842 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.95 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  27.42 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  26.27 
 
 		 610 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  27.84 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.53 
 
 		 998 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  26.4 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  21.88 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.53 
 
 		 998 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.26 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  21.58 
 
 		 642 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  24.56 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  21.88 
 
 		 642 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  27.71 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  27.64 
 
 		 601 aa  77.4  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  21.58 
 
 		 642 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  24.71 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  28.66 
 
 		 601 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  21.89 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  21.89 
 
 		 602 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  21.89 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>