154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2249 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  64.27 
 
 
585 aa  765    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  100 
 
 
585 aa  1208    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  100 
 
 
585 aa  1208    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  28.34 
 
 
655 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  27.95 
 
 
655 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  25 
 
 
653 aa  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  27.18 
 
 
656 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  27.18 
 
 
656 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  24.26 
 
 
720 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  26.22 
 
 
588 aa  140  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  27.47 
 
 
580 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25.49 
 
 
580 aa  133  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  26.1 
 
 
563 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  25.4 
 
 
633 aa  123  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  26.27 
 
 
610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  25.93 
 
 
637 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  22.91 
 
 
602 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  23.13 
 
 
602 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.13 
 
 
602 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  23.13 
 
 
602 aa  97.4  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  23.13 
 
 
602 aa  97.4  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  25.63 
 
 
584 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  25.63 
 
 
584 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  24.19 
 
 
991 aa  94  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  25.65 
 
 
608 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.57 
 
 
602 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  24.85 
 
 
577 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  23.08 
 
 
611 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  22.97 
 
 
594 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  22.57 
 
 
998 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  23.89 
 
 
998 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  23.06 
 
 
594 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  23 
 
 
562 aa  87.8  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.35 
 
 
602 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 
602 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  22.89 
 
 
591 aa  84  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.12 
 
 
612 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  25.47 
 
 
621 aa  82  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  22.86 
 
 
606 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.78 
 
 
557 aa  80.5  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.46 
 
 
592 aa  80.5  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.46 
 
 
592 aa  80.5  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  23.97 
 
 
619 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  25.51 
 
 
572 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.29 
 
 
612 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  22.35 
 
 
615 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  21.49 
 
 
580 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  22.84 
 
 
621 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.53 
 
 
578 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  23.08 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  25.17 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  22.44 
 
 
613 aa  74.7  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  22.68 
 
 
577 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  25.08 
 
 
640 aa  74.7  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  23.22 
 
 
604 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  23.25 
 
 
574 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  23.63 
 
 
610 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  23.63 
 
 
610 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  23.63 
 
 
612 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  22.22 
 
 
615 aa  73.6  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.63 
 
 
610 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  24.71 
 
 
813 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.18 
 
 
560 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  22.68 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  22.99 
 
 
587 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  22.15 
 
 
574 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  22.46 
 
 
1148 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  23.06 
 
 
582 aa  71.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  22.44 
 
 
580 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  20.83 
 
 
595 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  22.18 
 
 
519 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.03 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  23.03 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  22.44 
 
 
577 aa  70.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.44 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  23.11 
 
 
578 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  23.11 
 
 
578 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  23.57 
 
 
1153 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  22.91 
 
 
604 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  23.67 
 
 
600 aa  70.1  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  22.81 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  23.6 
 
 
645 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  23.01 
 
 
615 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  21.32 
 
 
590 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  21.56 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  22.44 
 
 
613 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  21.32 
 
 
590 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  21.54 
 
 
610 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  21.88 
 
 
580 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  25.35 
 
 
599 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  22.19 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  22.6 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  21.19 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  20.97 
 
 
799 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  21.69 
 
 
602 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  24.38 
 
 
596 aa  65.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  24.25 
 
 
599 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  22.7 
 
 
610 aa  65.1  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  26.26 
 
 
545 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  19.84 
 
 
570 aa  64.7  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>