146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2658 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  100 
 
 
572 aa  1192    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  43.56 
 
 
582 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  43.15 
 
 
577 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  42.23 
 
 
580 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  41.88 
 
 
580 aa  475  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  42.28 
 
 
582 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  42.33 
 
 
582 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  42.33 
 
 
582 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  40.28 
 
 
615 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  40.28 
 
 
621 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  36.6 
 
 
578 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  32.11 
 
 
601 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  30.66 
 
 
813 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  33.86 
 
 
639 aa  289  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  32.65 
 
 
599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  29.22 
 
 
614 aa  281  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  28.07 
 
 
621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  30.78 
 
 
614 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.78 
 
 
614 aa  258  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  30.45 
 
 
625 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  29.91 
 
 
629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  29.21 
 
 
615 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  28.52 
 
 
819 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  29.35 
 
 
635 aa  252  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  29.9 
 
 
616 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  29.55 
 
 
631 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  29.73 
 
 
631 aa  250  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  29.3 
 
 
842 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  29.11 
 
 
642 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  29.11 
 
 
642 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  28.93 
 
 
642 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  28.93 
 
 
642 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  28.49 
 
 
601 aa  242  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  29.31 
 
 
604 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
642 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  28.7 
 
 
608 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  29.13 
 
 
604 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  28.25 
 
 
607 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  29.13 
 
 
613 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  28.8 
 
 
597 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  27.88 
 
 
594 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  27.94 
 
 
596 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  27.65 
 
 
596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  28.57 
 
 
716 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  28.1 
 
 
602 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  28.42 
 
 
799 aa  190  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  28.16 
 
 
610 aa  190  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  27.74 
 
 
610 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.74 
 
 
610 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  27.74 
 
 
610 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  27.74 
 
 
612 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  27.42 
 
 
618 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  27.88 
 
 
619 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.51 
 
 
612 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.51 
 
 
612 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  28.77 
 
 
1148 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.54 
 
 
577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  26.93 
 
 
613 aa  163  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  31.27 
 
 
562 aa  159  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  28.08 
 
 
617 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.83 
 
 
589 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.69 
 
 
592 aa  147  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.69 
 
 
592 aa  147  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  29.55 
 
 
998 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  29.12 
 
 
998 aa  143  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  26.89 
 
 
577 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.83 
 
 
615 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  28.83 
 
 
991 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  26.87 
 
 
1153 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  26.92 
 
 
563 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  23.36 
 
 
613 aa  86.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.02 
 
 
580 aa  84.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  23.45 
 
 
925 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  24.94 
 
 
601 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25.48 
 
 
574 aa  80.9  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  26.85 
 
 
584 aa  80.5  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  26.85 
 
 
584 aa  80.5  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  24.28 
 
 
580 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  26.43 
 
 
574 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  25.99 
 
 
574 aa  77.8  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  23.53 
 
 
590 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  23.53 
 
 
590 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  25.38 
 
 
655 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  25.51 
 
 
585 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  25.51 
 
 
585 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  22.61 
 
 
720 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  23.68 
 
 
655 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  24.41 
 
 
653 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  24.36 
 
 
601 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  25 
 
 
578 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  23.02 
 
 
599 aa  70.1  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  24.75 
 
 
581 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  23.44 
 
 
810 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  24.38 
 
 
645 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  24.71 
 
 
585 aa  68.2  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  21.7 
 
 
610 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.42 
 
 
575 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  22.78 
 
 
575 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  23.15 
 
 
633 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  22.29 
 
 
611 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>