157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6952 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  100 
 
 
1153 aa  2299    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  36.97 
 
 
1148 aa  602  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  38.88 
 
 
619 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  38.13 
 
 
618 aa  373  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  40.78 
 
 
589 aa  354  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  33.8 
 
 
612 aa  332  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  34.14 
 
 
610 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  34.14 
 
 
610 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  34.14 
 
 
612 aa  331  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  34.14 
 
 
610 aa  330  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  35.11 
 
 
592 aa  327  9e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  35.11 
 
 
592 aa  327  9e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  39.16 
 
 
617 aa  327  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  33.33 
 
 
612 aa  326  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  34.66 
 
 
610 aa  325  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  33.45 
 
 
613 aa  308  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  36.44 
 
 
562 aa  306  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  35.8 
 
 
577 aa  305  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  36.08 
 
 
577 aa  299  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  36.01 
 
 
998 aa  278  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  36.03 
 
 
998 aa  277  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  40.15 
 
 
611 aa  267  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  38.29 
 
 
991 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  39.92 
 
 
608 aa  254  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  33.99 
 
 
578 aa  248  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  33.99 
 
 
578 aa  248  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  31.73 
 
 
615 aa  241  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  33.39 
 
 
578 aa  206  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  34.06 
 
 
615 aa  198  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  31.22 
 
 
599 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.61 
 
 
813 aa  188  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  27.24 
 
 
629 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  27.24 
 
 
631 aa  184  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  28.04 
 
 
625 aa  180  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  29.92 
 
 
596 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  26.08 
 
 
642 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  31.68 
 
 
635 aa  178  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  28.52 
 
 
601 aa  177  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  26.9 
 
 
631 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  28.42 
 
 
601 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  28.52 
 
 
614 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  25.65 
 
 
642 aa  175  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  25.82 
 
 
642 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  24.92 
 
 
642 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  31.46 
 
 
602 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  25.48 
 
 
642 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  24.24 
 
 
615 aa  171  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.99 
 
 
614 aa  171  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  29.41 
 
 
613 aa  171  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  27.99 
 
 
614 aa  171  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  29.19 
 
 
596 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  27.48 
 
 
621 aa  170  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  31.2 
 
 
586 aa  169  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  25.26 
 
 
639 aa  167  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  28.31 
 
 
613 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  30.61 
 
 
621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  29.7 
 
 
645 aa  164  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  31.58 
 
 
610 aa  163  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  28.38 
 
 
591 aa  162  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  28.24 
 
 
594 aa  160  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.72 
 
 
604 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  31.39 
 
 
576 aa  158  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  21.89 
 
 
819 aa  157  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  27.7 
 
 
597 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  30.96 
 
 
584 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  31.11 
 
 
582 aa  155  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  33.86 
 
 
601 aa  156  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  30.28 
 
 
601 aa  155  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.18 
 
 
580 aa  155  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.6 
 
 
810 aa  154  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  26.51 
 
 
604 aa  154  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  25.33 
 
 
608 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  33.57 
 
 
616 aa  152  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.17 
 
 
580 aa  151  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  29.83 
 
 
595 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.99 
 
 
582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.44 
 
 
577 aa  149  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  30.66 
 
 
586 aa  149  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  30.97 
 
 
609 aa  149  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  28.28 
 
 
596 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.17 
 
 
582 aa  149  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  30.17 
 
 
582 aa  149  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  34.3 
 
 
570 aa  148  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  24.75 
 
 
607 aa  148  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.32 
 
 
578 aa  146  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  27.39 
 
 
610 aa  146  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  25.16 
 
 
602 aa  145  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  28.34 
 
 
672 aa  145  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  27 
 
 
580 aa  145  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.16 
 
 
602 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  25.22 
 
 
842 aa  144  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  30.24 
 
 
799 aa  144  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  31.26 
 
 
599 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  25.13 
 
 
560 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.61 
 
 
602 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  25.33 
 
 
602 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  25.33 
 
 
602 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  26.46 
 
 
684 aa  141  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  31.66 
 
 
594 aa  140  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  31.82 
 
 
594 aa  140  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>