136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2439 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  56.51 
 
 		 601 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  56.85 
 
 		 629 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  56.85 
 
 		 631 aa  705    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  55.5 
 
 		 631 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  56.42 
 
 		 642 aa  700    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  56.76 
 
 		 642 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  56.93 
 
 		 642 aa  705    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  100 
 
 		 604 aa  1263    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  56.93 
 
 		 642 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  99.67 
 
 		 604 aa  1258    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  52.25 
 
 		 819 aa  655    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  56.59 
 
 		 642 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  50.75 
 
 		 842 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  48.64 
 
 		 608 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  46.96 
 
 		 597 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  46.86 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  47.41 
 
 		 625 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  46.18 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  46.9 
 
 		 614 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  46.73 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  46.23 
 
 		 613 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  45.44 
 
 		 596 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  45.27 
 
 		 596 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  45.29 
 
 		 607 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  42.6 
 
 		 602 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  43.37 
 
 		 799 aa  478  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  37.42 
 
 		 639 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  36.9 
 
 		 615 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  35.45 
 
 		 813 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  33.68 
 
 		 614 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  33.86 
 
 		 601 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  33.64 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  30.56 
 
 		 621 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  29.88 
 
 		 621 aa  263  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  28.77 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  28.84 
 
 		 615 aa  257  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  29.31 
 
 		 572 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.8 
 
 		 582 aa  252  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  30.99 
 
 		 616 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.77 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.77 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  28.47 
 
 		 577 aa  248  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.86 
 
 		 580 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.38 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.09 
 
 		 612 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.09 
 
 		 612 aa  226  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  27.18 
 
 		 716 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.4 
 
 		 610 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  24.79 
 
 		 610 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.45 
 
 		 610 aa  220  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  24.45 
 
 		 610 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  24.62 
 
 		 612 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.4 
 
 		 578 aa  217  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.08 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.29 
 
 		 618 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  28.33 
 
 		 617 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.32 
 
 		 1148 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  23.26 
 
 		 613 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.23 
 
 		 562 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.58 
 
 		 592 aa  167  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.58 
 
 		 592 aa  167  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  26.39 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  26.04 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.53 
 
 		 998 aa  160  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.3 
 
 		 998 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.74 
 
 		 1153 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 		 991 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.91 
 
 		 577 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  23.18 
 
 		 615 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.13 
 
 		 580 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  24.13 
 
 		 580 aa  98.2  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  23.41 
 
 		 563 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  24.09 
 
 		 633 aa  89  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  22.02 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  22.16 
 
 		 655 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  18.93 
 
 		 588 aa  81.6  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  25.29 
 
 		 925 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  21.35 
 
 		 575 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  21.73 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  21.43 
 
 		 637 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.38 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.38 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  22.7 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  23.84 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  21.03 
 
 		 720 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  20.53 
 
 		 611 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.68 
 
 		 656 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.68 
 
 		 656 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  25.69 
 
 		 637 aa  66.6  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  25.5 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23.22 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  23.22 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  21.62 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  21.62 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  23.66 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  22.55 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  24.56 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  21.81 
 
 		 610 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  21.9 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  23.32 
 
 		 557 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>