More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4056 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  88.68 
 
 		 991 aa  1704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 998 aa  1972    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  95.79 
 
 		 998 aa  1892    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  50.18 
 
 		 577 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  49.56 
 
 		 577 aa  506  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  48.24 
 
 		 562 aa  502  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4394  acyl-CoA synthetase  60.05 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2300  acyl-CoA synthetase  58.43 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2630  acyl-CoA synthetase  56.06 
 
 		 421 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  40.9 
 
 		 615 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3524  acyl-CoA synthetase  45.28 
 
 		 433 aa  354  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  32.69 
 
 		 610 aa  326  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  32.52 
 
 		 610 aa  326  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.69 
 
 		 610 aa  326  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  32.69 
 
 		 612 aa  326  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  32.69 
 
 		 610 aa  326  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.34 
 
 		 612 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  31.99 
 
 		 612 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  37.79 
 
 		 1148 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  32.64 
 
 		 613 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  35.76 
 
 		 619 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  35.59 
 
 		 617 aa  279  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  33.79 
 
 		 618 aa  278  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1846  acyl-CoA synthetase  35.77 
 
 		 412 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.259612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2018  acyl-CoA synthetase  36.67 
 
 		 412 aa  270  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.75082e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1840  acyl-CoA synthetase  36.92 
 
 		 412 aa  270  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1814  acyl-CoA synthetase  36.92 
 
 		 412 aa  270  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0396009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  36.71 
 
 		 1153 aa  270  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1983  acyl-CoA synthetase  36.92 
 
 		 412 aa  270  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1985  acyl-CoA synthetase  35.12 
 
 		 412 aa  268  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1797  acyl-CoA synthetase  36.48 
 
 		 412 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3344  acyl-CoA synthetase  35.37 
 
 		 412 aa  265  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  hitchhiker  0.0000000000000207537 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  36.4 
 
 		 589 aa  251  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  27.11 
 
 		 592 aa  241  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  27.11 
 
 		 592 aa  241  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  33.26 
 
 		 594 aa  195  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  33.81 
 
 		 621 aa  188  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  31.13 
 
 		 597 aa  183  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  31.11 
 
 		 625 aa  182  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  31.76 
 
 		 582 aa  182  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  29.68 
 
 		 614 aa  179  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  32.86 
 
 		 577 aa  179  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  31.08 
 
 		 635 aa  174  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  34.74 
 
 		 596 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  36.22 
 
 		 615 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  32.6 
 
 		 613 aa  173  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  29.82 
 
 		 582 aa  172  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.82 
 
 		 582 aa  172  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  33.19 
 
 		 580 aa  171  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.18 
 
 		 582 aa  170  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  32.01 
 
 		 580 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  27.87 
 
 		 642 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  27.63 
 
 		 642 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  35.71 
 
 		 596 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  27.4 
 
 		 642 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  27.4 
 
 		 642 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  27.1 
 
 		 642 aa  162  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  26.71 
 
 		 629 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.04 
 
 		 604 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  26.71 
 
 		 601 aa  159  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  26.95 
 
 		 631 aa  159  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  31 
 
 		 842 aa  157  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  26.71 
 
 		 631 aa  156  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  26.81 
 
 		 604 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  26.08 
 
 		 819 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  27.57 
 
 		 607 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.46 
 
 		 614 aa  147  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  26.3 
 
 		 614 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  24.89 
 
 		 615 aa  144  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  29.55 
 
 		 599 aa  144  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  29.55 
 
 		 572 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  30.43 
 
 		 799 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  29.37 
 
 		 601 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  31.93 
 
 		 602 aa  141  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  25.99 
 
 		 813 aa  140  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  25.17 
 
 		 608 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.58 
 
 		 578 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  26.71 
 
 		 639 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  28.54 
 
 		 621 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 544 aa  120  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  29.95 
 
 		 563 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 569 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  35.2 
 
 		 616 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  27.91 
 
 		 611 aa  112  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  25.23 
 
 		 453 aa  111  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  27.13 
 
 		 584 aa  108  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6185  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 574 aa  107  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 492 aa  107  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.5 
 
 		 512 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.04 
 
 		 557 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  24.49 
 
 		 490 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 549 aa  107  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  28.31 
 
 		 4575 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.84 
 
 		 557 aa  104  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.84 
 
 		 557 aa  104  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.84 
 
 		 557 aa  104  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.84 
 
 		 557 aa  104  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.79 
 
 		 557 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>