More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2630 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2630  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 421 aa  852    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261373  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2300  acyl-CoA synthetase  73.63 
 
 		 423 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4394  acyl-CoA synthetase  73.67 
 
 		 423 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  57.72 
 
 		 991 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  56.06 
 
 		 998 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  57.18 
 
 		 998 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3524  acyl-CoA synthetase  46.95 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1846  acyl-CoA synthetase  39.2 
 
 		 412 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.259612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3344  acyl-CoA synthetase  39.36 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  hitchhiker  0.0000000000000207537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1985  acyl-CoA synthetase  38.67 
 
 		 412 aa  289  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2018  acyl-CoA synthetase  38.93 
 
 		 412 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.75082e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1814  acyl-CoA synthetase  38.93 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0396009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1840  acyl-CoA synthetase  38.93 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1983  acyl-CoA synthetase  38.93 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1797  acyl-CoA synthetase  38.67 
 
 		 412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.77 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1886  pseudouridine synthase, Rsu  28.61 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 		 503 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  24.51 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  23.18 
 
 		 487 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 544 aa  97.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  22.45 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  26.06 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 569 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  23.4 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1530  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 		 522 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  23.66 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  23.18 
 
 		 559 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  26.76 
 
 		 4575 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  25 
 
 		 487 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 503 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.22 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03427  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.72 
 
 		 522 aa  93.6  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.831251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  26.41 
 
 		 500 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  22.89 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.58 
 
 		 518 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 518 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  23.18 
 
 		 559 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  22.96 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 518 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.51 
 
 		 518 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 549 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  24.87 
 
 		 549 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 566 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  22.56 
 
 		 487 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 		 578 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 509 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  27.71 
 
 		 557 aa  90.1  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 561 aa  89.7  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.58 
 
 		 518 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  24.82 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3958  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 707 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 558 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1183  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 560 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 		 572 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  22.39 
 
 		 7122 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0307  AMP-dependent synthetase and ligase  26.02 
 
 		 571 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0610213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 561 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6185  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 574 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 487 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  23.42 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 535 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  24.13 
 
 		 6676 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.29 
 
 		 518 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 537 aa  87  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 569 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 559 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  26.29 
 
 		 559 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 506 aa  87  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 559 aa  87  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2322  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 523 aa  86.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000119755  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.68 
 
 		 557 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  25.53 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  22.29 
 
 		 4968 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  26.92 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  25.47 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  25.65 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  28.46 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  25.11 
 
 		 6768 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  25.18 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  39.71 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  28.46 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  26.52 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.76 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.48 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5782  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6761  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  25.06 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>