More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0219 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  100 
 
 		 453 aa  939    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  29.13 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  30.23 
 
 		 487 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  29.16 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  29.07 
 
 		 559 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  28.87 
 
 		 487 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  28.87 
 
 		 559 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  28.75 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  28.66 
 
 		 487 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  28.66 
 
 		 559 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  28.45 
 
 		 487 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 507 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1955  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.52 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118802  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 		 509 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 506 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 472 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  23.29 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  23.31 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  23.12 
 
 		 546 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  23.65 
 
 		 546 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  24.69 
 
 		 541 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 		 545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  24.3 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  24.39 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  25.06 
 
 		 523 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  23.97 
 
 		 531 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.37 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  25.2 
 
 		 550 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  25 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.6 
 
 		 519 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  24.61 
 
 		 521 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  23.45 
 
 		 584 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  27.3 
 
 		 576 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 564 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  23.17 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  21.93 
 
 		 507 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  24.02 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 562 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  26.21 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  23.41 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  23.41 
 
 		 550 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  21.4 
 
 		 515 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  24.64 
 
 		 575 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  24.64 
 
 		 575 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  24.93 
 
 		 503 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  27.56 
 
 		 557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 		 545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  22.29 
 
 		 498 aa  120  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  23.73 
 
 		 549 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  22.62 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  24.79 
 
 		 575 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  25.09 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  23.31 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  27.92 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1489  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.81 
 
 		 556 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.149782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  26.2 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.71 
 
 		 579 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  22.89 
 
 		 569 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  25.85 
 
 		 552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  23.09 
 
 		 504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  24.94 
 
 		 529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  23.98 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  23.96 
 
 		 502 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 		 521 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  20.55 
 
 		 514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  25.78 
 
 		 565 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  25.77 
 
 		 553 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  25.33 
 
 		 538 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  26.97 
 
 		 571 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  21.79 
 
 		 530 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  22.81 
 
 		 564 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  26.12 
 
 		 546 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  21.79 
 
 		 517 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  25.71 
 
 		 576 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  26.27 
 
 		 570 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  25.96 
 
 		 507 aa  116  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.84 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  22.82 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  21.72 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  27.27 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>