More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4103 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 545 aa  1103    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  59.51 
 
 		 550 aa  628  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  59.39 
 
 		 544 aa  614  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  52.82 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  49.81 
 
 		 532 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  48.18 
 
 		 542 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  48.56 
 
 		 541 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  46.96 
 
 		 531 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  44.51 
 
 		 560 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  44.38 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  43.18 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  43.92 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  43.92 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  43.92 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  43.35 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  43.31 
 
 		 548 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  43.95 
 
 		 569 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  43.97 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  43.31 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  43.31 
 
 		 548 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  42.16 
 
 		 535 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  42.54 
 
 		 535 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  42.4 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  43.24 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  42.16 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  42.43 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  42.75 
 
 		 544 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  43.19 
 
 		 539 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  43.41 
 
 		 550 aa  360  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 		 562 aa  349  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 560 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 515 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 510 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.66 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.26 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 506 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.33 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 516 aa  227  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.95 
 
 		 516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 509 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 516 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 532 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  31.61 
 
 		 527 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  31.62 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  33.2 
 
 		 492 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  31.76 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.27 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  31.89 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.76 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 525 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  30.54 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  32.21 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.74 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 516 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 546 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 519 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.91 
 
 		 522 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 		 497 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 		 497 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 509 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  31.12 
 
 		 501 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  31.08 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 		 501 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 		 501 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.2 
 
 		 509 aa  207  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.04 
 
 		 516 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.08 
 
 		 514 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  31.61 
 
 		 487 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 508 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 511 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 538 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.8 
 
 		 512 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  33.41 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 550 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 523 aa  203  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.01 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3722  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.51 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 518 aa  200  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 		 516 aa  199  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>