More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0598 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
458 aa  952    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
458 aa  952    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  43.6 
 
 
453 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  28.98 
 
 
487 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  29.63 
 
 
487 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  28.78 
 
 
487 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  29.07 
 
 
487 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  29.36 
 
 
559 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  28.81 
 
 
559 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  28.87 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  29.16 
 
 
559 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  28.81 
 
 
487 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  28.87 
 
 
487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
509 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 
468 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 
468 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1955  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.96 
 
 
414 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118802  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 
507 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 
506 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  23.52 
 
 
472 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 
541 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 
459 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 
495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  24.75 
 
 
544 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
498 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  25.07 
 
 
549 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 
530 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  25.47 
 
 
552 aa  127  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  26.78 
 
 
547 aa  126  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  25.21 
 
 
549 aa  126  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.8 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  24.79 
 
 
549 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  26.78 
 
 
552 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 
527 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  27.06 
 
 
587 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  26.59 
 
 
579 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  26.26 
 
 
549 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  24.73 
 
 
552 aa  123  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  24.93 
 
 
552 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  25.36 
 
 
544 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  23.05 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  23.26 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  24.38 
 
 
524 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  25.14 
 
 
550 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  21.73 
 
 
539 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  19.58 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  23.55 
 
 
519 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 
566 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  24.65 
 
 
506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  25.43 
 
 
549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  23.26 
 
 
503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  25.21 
 
 
540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  25.21 
 
 
540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0025  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  26.87 
 
 
497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
541 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  24.93 
 
 
540 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  24.36 
 
 
511 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  22.83 
 
 
530 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  25.46 
 
 
510 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  23.08 
 
 
560 aa  117  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 
1043 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  24.07 
 
 
553 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 
518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  25.43 
 
 
549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  26.12 
 
 
546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  25.42 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  26.9 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  22.2 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 
530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  23.74 
 
 
548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  25.53 
 
 
538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  25.21 
 
 
538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  25.5 
 
 
596 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  25.5 
 
 
548 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26 
 
 
479 aa  114  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  24.57 
 
 
549 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  24.72 
 
 
531 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 
558 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  25.93 
 
 
575 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 
505 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  22.97 
 
 
503 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 
545 aa  113  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 
551 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 
566 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.25 
 
 
486 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  26.04 
 
 
545 aa  113  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  25.85 
 
 
543 aa  113  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.63 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.41 
 
 
526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  20.7 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  28 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  27.87 
 
 
549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  25.28 
 
 
576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  24.86 
 
 
579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>