More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0553 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 527 aa  1030    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  52.26 
 
 		 542 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  48.12 
 
 		 532 aa  458  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  49.16 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  44.13 
 
 		 560 aa  428  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  49.51 
 
 		 541 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  43.77 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  43.77 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  43.19 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  43.3 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  43.58 
 
 		 574 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  45.57 
 
 		 535 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  46.52 
 
 		 548 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  46.31 
 
 		 548 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  46.31 
 
 		 548 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  45.78 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  45.68 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  44.65 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  44.66 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  45.19 
 
 		 546 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  42.3 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  43.97 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  44.56 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  44.91 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  44.99 
 
 		 544 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  43.1 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  43.33 
 
 		 544 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  43.73 
 
 		 531 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 		 550 aa  352  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 562 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  40.91 
 
 		 560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 518 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 536 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 		 512 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.16 
 
 		 494 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  33.66 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  33.27 
 
 		 565 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  30.64 
 
 		 515 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  30.64 
 
 		 515 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 515 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  33.26 
 
 		 492 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.06 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  31.26 
 
 		 516 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  29.98 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 520 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  30.94 
 
 		 500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.3 
 
 		 500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 520 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  31.42 
 
 		 500 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 515 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  31.15 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.38 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  31.15 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  30.53 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.74 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  31.46 
 
 		 488 aa  211  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 515 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.83 
 
 		 513 aa  210  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.94 
 
 		 497 aa  210  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  30.37 
 
 		 516 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.84 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  30.43 
 
 		 499 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 508 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 516 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.86 
 
 		 509 aa  206  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  32.91 
 
 		 487 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.09 
 
 		 481 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 546 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.64 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  30.6 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  30.2 
 
 		 529 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.24 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 515 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  32.67 
 
 		 532 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 		 524 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 500 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 662 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 516 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  35.2 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>