More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4816 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 562 aa  1115    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  56.27 
 
 		 541 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  52.04 
 
 		 546 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 539 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  48.7 
 
 		 532 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  46.22 
 
 		 534 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  47.11 
 
 		 541 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  43.33 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  42.2 
 
 		 548 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  42.2 
 
 		 548 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  42.2 
 
 		 548 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 		 560 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  40.96 
 
 		 535 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  41.22 
 
 		 530 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  40.3 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  42.46 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  40.15 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  39.86 
 
 		 544 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  39.25 
 
 		 544 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  38.56 
 
 		 560 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 		 545 aa  346  6e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 		 542 aa  345  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  42.28 
 
 		 527 aa  342  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  40.08 
 
 		 550 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  38.52 
 
 		 577 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  38.52 
 
 		 577 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  38.33 
 
 		 574 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  36.81 
 
 		 569 aa  323  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  37.25 
 
 		 564 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  37.82 
 
 		 531 aa  293  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 518 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 536 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.91 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 508 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 		 524 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.46 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 		 526 aa  200  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 499 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 552 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.25 
 
 		 501 aa  197  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 521 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  32.23 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.76 
 
 		 499 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 516 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.23 
 
 		 509 aa  193  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 548 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.88 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 512 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.54 
 
 		 514 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  27.58 
 
 		 544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 546 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.82 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 518 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.02 
 
 		 512 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.59 
 
 		 500 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 596 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.61 
 
 		 529 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 520 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 516 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.24 
 
 		 503 aa  179  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  29.1 
 
 		 522 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 511 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.34 
 
 		 522 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 630 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 523 aa  177  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 511 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 495 aa  177  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  25.19 
 
 		 558 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 508 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 508 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  27.36 
 
 		 570 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  29.35 
 
 		 556 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  26.85 
 
 		 547 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  28.92 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.41 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  28.77 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  28.77 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.64 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 		 662 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.82 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.52 
 
 		 550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.25 
 
 		 518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 524 aa  174  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  29.9 
 
 		 487 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.1 
 
 		 506 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>