More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6898 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 536 aa  1050    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 532 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 534 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 539 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  32.82 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 541 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 527 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 550 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  33.47 
 
 		 544 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  32.42 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  32.42 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  32.42 
 
 		 548 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  31.49 
 
 		 560 aa  220  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  33 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 518 aa  216  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 560 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  30.91 
 
 		 569 aa  204  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  30.31 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  30.26 
 
 		 574 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  29.86 
 
 		 577 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  29.86 
 
 		 577 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 544 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 545 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  30.58 
 
 		 550 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 516 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 		 495 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  33.41 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  27.22 
 
 		 500 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.01 
 
 		 500 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  26.6 
 
 		 500 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.47 
 
 		 514 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  26.54 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  26.54 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  26.54 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  26.12 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.54 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.72 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.69 
 
 		 498 aa  163  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  25.98 
 
 		 500 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  29.59 
 
 		 552 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  29.38 
 
 		 526 aa  160  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 		 533 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.2 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  27.91 
 
 		 533 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.9 
 
 		 512 aa  156  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  30.52 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 513 aa  154  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 527 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  27.61 
 
 		 515 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  27.61 
 
 		 515 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  27.38 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.44 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 528 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  28.92 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  28 
 
 		 542 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  27.24 
 
 		 556 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  27.47 
 
 		 549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  28.54 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  30.14 
 
 		 510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.02 
 
 		 662 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  30.5 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.77 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.29 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 551 aa  147  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  28.97 
 
 		 545 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 520 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.57 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.4 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  28.98 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  30.1 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  28.32 
 
 		 555 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  25.93 
 
 		 518 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.77 
 
 		 510 aa  143  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.81 
 
 		 510 aa  143  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  29.46 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  28.28 
 
 		 506 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0671  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251823  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.69 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.49 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>