More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4127 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 540 aa  1095    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  71.96 
 
 		 548 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  72.05 
 
 		 530 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  72.92 
 
 		 535 aa  790    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  74.53 
 
 		 535 aa  792    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  72.69 
 
 		 548 aa  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  73.63 
 
 		 544 aa  790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  72.69 
 
 		 548 aa  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  73.67 
 
 		 544 aa  789    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  55.78 
 
 		 550 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  47.95 
 
 		 532 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  46.4 
 
 		 541 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  44.81 
 
 		 539 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  45.05 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  44.96 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  42.58 
 
 		 560 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 534 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  42.43 
 
 		 564 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  43.29 
 
 		 574 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  42.23 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  43.29 
 
 		 577 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  43.24 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  43.29 
 
 		 577 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  42.04 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  44.56 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 		 562 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 544 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 560 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  40.66 
 
 		 531 aa  317  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 518 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 532 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 536 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  31.95 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.58 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.57 
 
 		 524 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 		 518 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 552 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.06 
 
 		 525 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  30.8 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.92 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.36 
 
 		 543 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.51 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.54 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.04 
 
 		 514 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.46 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 518 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 523 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  30.75 
 
 		 531 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  32.06 
 
 		 565 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.65 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.74 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.74 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.74 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.44 
 
 		 525 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  32.87 
 
 		 515 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  32.87 
 
 		 515 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 512 aa  210  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 523 aa  210  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.67 
 
 		 525 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  32.81 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  30.26 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.87 
 
 		 555 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 512 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 501 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 501 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.64 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.57 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.64 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.26 
 
 		 525 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  30.06 
 
 		 516 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  32.21 
 
 		 527 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 508 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.14 
 
 		 519 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.07 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.47 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 525 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 487 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.79 
 
 		 528 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 		 513 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 500 aa  200  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 546 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  29.61 
 
 		 516 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>