More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4602 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 506 aa  1011    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  63.2 
 
 		 494 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  62.99 
 
 		 494 aa  527  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 487 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 459 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  34.07 
 
 		 487 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 487 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  34.25 
 
 		 559 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  33.97 
 
 		 559 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  32.8 
 
 		 487 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  33.43 
 
 		 487 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 487 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  33.97 
 
 		 559 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  32.14 
 
 		 487 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 468 aa  183  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  26.45 
 
 		 453 aa  157  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2026  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.27 
 
 		 517 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 507 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 		 498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  31.21 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 472 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 504 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 		 508 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 474 aa  126  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.86 
 
 		 514 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.61 
 
 		 520 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 521 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0520634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 502 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.02 
 
 		 499 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  27.62 
 
 		 583 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  30.73 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.86 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  29.2 
 
 		 577 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  29.2 
 
 		 577 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  29.2 
 
 		 574 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.41 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.41 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  28.85 
 
 		 560 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.86 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.42 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22250  AMP-dependent synthetase and ligase protein  31.43 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219282  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 545 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.14 
 
 		 506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  26.65 
 
 		 508 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  30.7 
 
 		 548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 532 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  25.91 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  30.64 
 
 		 548 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 506 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  30.64 
 
 		 548 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 516 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6839  acyl-CoA synthetase  28.85 
 
 		 503 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189698  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.06 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  26 
 
 		 565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 507 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4116  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  25 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.02 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  26.74 
 
 		 560 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  28.28 
 
 		 517 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 535 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.57 
 
 		 506 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>