More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4735 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 509 aa  1026    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  83.1 
 
 		 507 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 468 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 495 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 487 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  28.71 
 
 		 487 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  28.16 
 
 		 487 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  28.16 
 
 		 559 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  28.63 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  28.63 
 
 		 559 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  28.16 
 
 		 559 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  28.97 
 
 		 487 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  28.43 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  29.11 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 459 aa  194  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  27.9 
 
 		 487 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  25.05 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  28.6 
 
 		 548 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  28.6 
 
 		 548 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  28.6 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 494 aa  143  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  29.18 
 
 		 540 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 525 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  28.38 
 
 		 579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  30.52 
 
 		 539 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 508 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  26.87 
 
 		 545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  26.25 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  29.46 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 534 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.25 
 
 		 474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  27.67 
 
 		 535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29.36 
 
 		 576 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 566 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  27.31 
 
 		 530 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.09 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  29.25 
 
 		 546 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.31 
 
 		 587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  27.14 
 
 		 596 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  29.44 
 
 		 576 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.34 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  28.84 
 
 		 542 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.2 
 
 		 524 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 521 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  27.72 
 
 		 552 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  27.1 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  25.48 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  25.48 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.46 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 		 539 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4116  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 499 aa  124  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  25.96 
 
 		 564 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  28.65 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1955  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.43 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118802  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  28.28 
 
 		 545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  25.24 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  26.99 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  28.91 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  28.21 
 
 		 552 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  28.38 
 
 		 575 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  28.31 
 
 		 547 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  26.07 
 
 		 503 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  27.3 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 		 596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  28.57 
 
 		 577 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  26.27 
 
 		 584 aa  120  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2026  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 		 517 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 562 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  29.75 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.651864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>